১৯৬০ সালে এই ইউনিয়ন পরিষদ স্থাপিত। ২০০৮ সালে পরিষদের কমপ্লেক্স ভবন নির্মিত হয়। এই ইউনিয়নের কুতুবপুর গ্রামে রয়েছে ওলী দেওয়ান হযরত কুতুব উদ্দিন (রহঃ) এর রওজা শরীফ। এই ওলী দেওয়ান হযরত কুতুব উদ্দিন (রহঃ) এর নামানুসারে পরিষদের নামকরণ করা হয় কুতুবপুর ইউনিয়ন পরিষদ। এই ইউনিয়নের প্রথম চেয়ারম্যান এস কে মুখার্জি। কুতুবপুর ইউনিয়ন পরিষদ কার্যালয়টি সরোজগঞ্জ বাজারে অবস্থিত। এর পূর্বে ঝিনাইদহের সাধুহাটি ইউপি, পশ্চিমে চুয়াডাঙ্গা সদরের পদ্মবিলা ইউপি, উত্তরে আলমডাঙ্গা উপজেলার খাসকররা ও নাগদহ ইউপি এবং দক্ষিণে চুয়াডাঙ্গা সদর উপজেলার তিতুদহ ইউপি অবস্থিত। চুয়াডাঙ্গা জেলা শহর থেকে এর দূরত্ব ৮ কি:মি:। ইউনিয়ন এর বর্তমান চেয়ারম্যান জনাব মোঃ নজরুল ইসলাম।
Planning and Implementation: Cabinet Division, A2I, BCC, DoICT and BASIS